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項(xiàng)目介紹

TMT是一種基于等重同位素的標(biāo)記定量蛋白組學(xué)技術(shù)，而TMT修飾組是將TMT與磷酸化/乙?；揎椊Y(jié)合的翻譯后修飾組學(xué)。它借助于TMT標(biāo)記、分級(jí)的優(yōu)勢(shì)達(dá)到了在保證樣本間重復(fù)穩(wěn)定性的同時(shí)實(shí)現(xiàn)更高檢測(cè)深度的優(yōu)勢(shì)。

技術(shù)路線

技術(shù)優(yōu)勢(shì)

1. 同一批次標(biāo)記定量穩(wěn)定性高。

2. 通過分級(jí)方法可大大增加修飾位點(diǎn)的鑒定深度。

數(shù)據(jù)分析

1、標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容

鑒定分析：鑒定與定量結(jié)果統(tǒng)計(jì);單個(gè)樣本蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果統(tǒng)計(jì);韋恩圖。

表達(dá)差異分析：差異結(jié)果統(tǒng)計(jì);差異結(jié)果柱狀圖;火山圖;聚類分析圖。

多組的比較分析(組別>=3)：mufzz聚類;雷達(dá)圖;箱線圖。

功能分析：亞細(xì)胞定位;結(jié)構(gòu)域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作網(wǎng)絡(luò)分析。

質(zhì)量控制分析：肽段離子質(zhì)量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質(zhì)豐度比分布。

2、高級(jí)數(shù)據(jù)分析

功能分析：GSEA富集分析。

臨床藥物研究：藥物靶點(diǎn)注釋。

標(biāo)志物篩選：集成機(jī)器學(xué)習(xí)。

與臨床表征的聯(lián)合分析：熱圖;弦圖;ROC分析;WGCNA分析。

推薦組合產(chǎn)品

TMT+TMT磷酸化

樣品要求

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常見問題

學(xué)術(shù)文章

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