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項(xiàng)目介紹

MeDIP-Seq（Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing ）采用甲基化DNA免疫共沉淀技術(shù)，通過5'-甲基胞嘧啶抗體特異性富集基因組上發(fā)生甲基化的DNA片段并進(jìn)行高通量測序。研究者通過MeDIP Sequencing可以快速有效地尋找基因組上的甲基化區(qū)域，從而比較不同樣本間DNA甲基化修飾模式的差異。此方法可以覆蓋整個(gè)基因組范圍的甲基化區(qū)域并且成本較低，特別適用于多樣品的全基因組DNA表觀遺傳研究。

技術(shù)特點(diǎn)

1、檢測疾病樣本中DNA甲基化信號富集區(qū)域并推斷樣本中表達(dá)被 抑制的候選基因集合。

2、檢測疾病發(fā)生發(fā)展不同時(shí)期，病灶部位的DNA甲基化動態(tài)圖譜，篩選表觀遺傳標(biāo)志幫助界定疾病發(fā)展程度。

3、比較疾病樣本和正常樣本中DNA甲基化區(qū)域的信號和位置分布的差異，篩選疾病特異性DNA甲基化區(qū)域，觀察這些區(qū)域周圍的基因，縮小疾病相關(guān)候選基因范圍。

實(shí)驗(yàn)流程

分析流程

標(biāo)準(zhǔn)分析

（1） 數(shù)據(jù)過濾及比對

（2） MeDIP分布趨勢分析

高級分析

（3） MeDIP富集peak信息

（4） 基于peak的多樣品間差異分析

樣品要求

樣本要求：

DNA濃度≥10ng/ul ，總量≥2ug    

細(xì)胞數(shù)≥1ⅹ107

項(xiàng)目案列

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