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南京農(nóng)業(yè)大學(xué)（第一單位）：迎來(lái)首篇《Cell》！

來(lái)源：科學(xué)10分鐘時(shí)間：2022-05-05 09:18:02 瀏覽：2814次

2022年2月15日，南京農(nóng)業(yè)大學(xué)粟碩，中山大學(xué)施莽及悉尼大學(xué)Edward C. Holmes共同通訊（南京農(nóng)業(yè)大學(xué)為第一通訊單位，何婉婷、侯新及趙晉為共同第一作者）在Cell 在線發(fā)表題為“Virome characterization of game animals in China reveals a spectrum of emerging pathogens”的研究論文，該研究對(duì)在中國(guó)采樣的 1941 只“野味”動(dòng)物（代表 18 個(gè)物種和 5 個(gè)哺乳動(dòng)物目）進(jìn)行了元轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析。由此確定了 102 種哺乳動(dòng)物感染病毒，其中 65 種為首次描述。21 種病毒被認(rèn)為對(duì)人類(lèi)和家畜具有潛在的高風(fēng)險(xiǎn)。

果子貍（Paguma larvata）攜帶的潛在高風(fēng)險(xiǎn)病毒數(shù)量最多。研究人員推斷蝙蝠冠狀病毒 HKU8 從蝙蝠到果子貍的傳播，以及冠狀病毒從蝙蝠到刺猬、從鳥(niǎo)類(lèi)到豪豬、從狗到貉的跨物種跳躍。值得注意的是，該研究在果子貍和亞洲獾中發(fā)現(xiàn)了禽流感 A 型病毒 H9N2，后者表現(xiàn)出呼吸道癥狀，以及可能的人類(lèi)與“野味”動(dòng)物病毒傳播的病例。這些數(shù)據(jù)突出了“野味”動(dòng)物作為疾病出現(xiàn)的潛在驅(qū)動(dòng)因素的重要性。該研究極大的拓展了對(duì)多種“野味”動(dòng)物攜帶病毒多樣性的認(rèn)識(shí)，為人類(lèi)和家畜疫病預(yù)警和防控提供了重要科學(xué)依據(jù)。

這是南京農(nóng)業(yè)大學(xué)首次以第一通訊作者單位在Cell 發(fā)表研究成果，也是我國(guó)動(dòng)物傳染病防控領(lǐng)域的突破性研究進(jìn)展。

哺乳動(dòng)物“野味”動(dòng)物是野生或半野生動(dòng)物，在中國(guó)和其他亞洲國(guó)家通常作為外來(lái)食物進(jìn)行交易和消費(fèi)。它們包括嚙齒動(dòng)物（如豪豬、竹鼠和土撥鼠）、食肉動(dòng)物（如果子貍、貉、獾和狐貍）、穿山甲、刺猬和兔子。這些動(dòng)物通常要么在當(dāng)?shù)夭东@和飼養(yǎng)，要么從鄰國(guó)非法進(jìn)口，然后再轉(zhuǎn)移到活體動(dòng)物（或“濕”）市場(chǎng)進(jìn)行交易。近幾十年來(lái)，商業(yè)“野味”動(dòng)物養(yǎng)殖業(yè)務(wù)及其物種多樣性有了重大擴(kuò)展。惡劣的衛(wèi)生條件和動(dòng)物與人類(lèi)之間的密切接觸，以及活體動(dòng)物市場(chǎng)和它們所服務(wù)的餐館中種類(lèi)繁多的物種，使它們成為新興傳染病的理想滋生地。

毫不奇怪，食用、捕獲、加工和/或交易“野味”動(dòng)物與數(shù)次傳染病暴發(fā)有關(guān)，并造成嚴(yán)重的公共衛(wèi)生后果。SARS-CoV 和 SARS-CoV-2 的早期病例分別在廣東省和湖北省的動(dòng)物市場(chǎng)及已經(jīng)在果子貍、貉子和穿山甲中發(fā)現(xiàn)了 SARS-CoV 和 SARS-CoV-2 的近親。這些是最受歡迎的外來(lái)“野味”動(dòng)物，經(jīng)常被交易和人類(lèi)消費(fèi)，盡管它們作為將這些病毒傳播給人類(lèi)的直接宿主的作用通常不確定。以類(lèi)似的方式，人類(lèi)免疫缺陷病毒 (HIV) 的多個(gè)譜系是獲得性免疫缺陷綜合征 (AIDS) 的病原體，可能起源于非洲中部和中西部的靈長(zhǎng)類(lèi)動(dòng)物。

文章模式圖（圖源自Cell ）

由于“野味”動(dòng)物經(jīng)常與重要的人類(lèi)疾病相關(guān)，因此識(shí)別這些物種中現(xiàn)有或潛在的病原體顯然很重要，這樣它們可用于追蹤特定流行病的起源，并對(duì)未來(lái)爆發(fā)的最可能來(lái)源進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估。自 2002/2003 年第一次 SARS-CoV 爆發(fā)以來(lái)，病毒發(fā)現(xiàn)研究已在各“野味”物物種中進(jìn)行，包括果子貍、穿山甲、土撥鼠和獾。最初，這些研究利用病毒分離、共識(shí) PCR 和 Sanger 測(cè)序，而近年來(lái)更多的注意力集中在宏基因組高通量測(cè)序上。

除了類(lèi) SARS 病毒外，這些研究還確定了幾種對(duì)人類(lèi)感染具有直接重要性的傳染原，例如來(lái)自果子貍和貉的輪狀病毒 A 以及野豬中的正肝炎病毒 A。已知這兩種病毒都會(huì)感染人類(lèi)以及廣泛的哺乳動(dòng)物宿主。盡管如此，很少有系統(tǒng)地研究“野味”動(dòng)物的病毒組，尤其是在中國(guó)，它們的消費(fèi)很普遍。

自 2002 年 SARS-CoV 出現(xiàn)以來(lái)，中國(guó)一直是“野味”動(dòng)物廣泛病毒監(jiān)測(cè)的重點(diǎn)，在蝙蝠身上發(fā)現(xiàn)了許多與 SARS-CoV-2 相關(guān)的病毒。然而，除穿山甲外，幾乎沒(méi)有對(duì)“野味”動(dòng)物進(jìn)行研究。為了填補(bǔ)這一空白，該研究對(duì)在中國(guó)收集的代表五個(gè)哺乳動(dòng)物目的 18 種“野味”動(dòng)物的病毒組進(jìn)行了系統(tǒng)的元轉(zhuǎn)錄組學(xué)（即總 RNA 測(cè)序）調(diào)查。許多物種首次在宏基因組框架內(nèi)進(jìn)行了研究。

野生動(dòng)物攜帶潛在人畜共患病病毒與宿主之間的關(guān)聯(lián)分析（圖源自Cell ）

該研究確定了 102 種哺乳動(dòng)物感染病毒，其中 65 種為首次描述。21 種病毒被認(rèn)為對(duì)人類(lèi)和家畜具有潛在的高風(fēng)險(xiǎn)。果子貍（Paguma larvata）攜帶的潛在高風(fēng)險(xiǎn)病毒數(shù)量最多。研究人員推斷蝙蝠冠狀病毒 HKU8 從蝙蝠到果子貍的傳播，以及冠狀病毒從蝙蝠到刺猬、從鳥(niǎo)類(lèi)到豪豬、從狗到貉的跨物種跳躍。

值得注意的是，該研究在果子貍和亞洲獾中發(fā)現(xiàn)了禽流感 A 型病毒 H9N2，后者表現(xiàn)出呼吸道癥狀，以及可能的人類(lèi)與“野味”動(dòng)物病毒傳播的病例。這些數(shù)據(jù)突出了“野味”動(dòng)物作為疾病出現(xiàn)的潛在驅(qū)動(dòng)因素的重要性。該研究極大的拓展了對(duì)多種“野味”動(dòng)物攜帶病毒多樣性的認(rèn)識(shí)，為人類(lèi)和家畜疫病預(yù)警和防控提供了重要科學(xué)依據(jù)。

本研究受到國(guó)家自然科學(xué)基金優(yōu)青基金（31922081）等項(xiàng)目支持資助，同時(shí)貉冠狀病毒流行病學(xué)研究得到了國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目課題“畜禽冠狀病毒的流行傳播特征與遺傳演化規(guī)律（2021YFD1801101）”支持資助。

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